Les questions de sécurité sanitaire ont très tôt retenu l’attention de l’Ifri : dynamique des épidémies, résilience des systèmes de santé, rôle des Etats, des organisations internationales et des ONG. Dès 2008, l'Ifri a par exemple lancé un programme triennal dédié à la santé et à l'environnement. Dans ce cadre, des travaux ont été conduits sur des sujets variés comme la grippe H1N1 ou la coopération sanitaire internationale.

Agissant comme un catalyseur des relations internationales, la pandémie de COVID-19 a accéléré et amplifié des tendances géopolitiques jusqu'alors latentes. Depuis le début de cette pandémie, l’Ifri a produit de nombreuses analyses sur ses conséquences mondiales, régionales ou sectorielles.